3月10日，曰本陆军由近卫师团、第2师团和第12师团组成的第1军，正式进驻朝鲜半岛，在鸭绿江西方大洋河口的大孤山实施登陆，然后直指奉天。而准备以第9、10、11师团组成第2军，在大连湾登陆，进攻旅顺。并计划将司令部设在大同江口的镇南浦。
同日，日本政府向华东政府发出外交函，向华东政府救援了29名日本士兵表示感谢，并且通知华东政府，希望将原定于3月份协商双方合作对俄作战推移到4月份，因此现在日本的军令部都在为日俄战争忙碌，实在是抽不出时间来，当然日本也再三的道歉。华东政府到也通情达礼，表示了理解，同意日本推迟协商的时间。
原来日本是希望在第二次闭塞作战之后再举行这次协商，如果第二次闭塞作战取得成功，那么日本将会在协商中取得较大的主动权。另外现在俄国远东舰队海参崴分舰队也开始出击，破坏日本的海上交通线，己击沉了两艘商船，海参崴分舰队的主力是两艘大型装甲巡洋舰：留里克号、格罗姆鲍伊号；大型防护巡洋舰壮士号，而现在联合舰队要全力对付太平洋舰队，分不出兵力在对付海参崴分舰队，因此第二次闭塞作战也成为战争进行关建。
联合舰队经过了认真的准备，这一次动的船只有4艘，为千代丸、副井丸、米山丸、弥彦丸，比第一次还要少1艘，因为秋山真之和其他参谋们商议之后，认为有了第一次闭塞作战的经验，而且己有一艘船沉在预定的地点，只需要再有二艘船沉在预定地点，也就足够阻塞住航道了，因此第二次闭塞作战的难度应该不大，4艘船就足够了，毕竟只要有50％的成功率就行。而参加闭塞作战军官，有闭塞作战计划的俱体策划者有马良橘、还有上一次唯一个将船沉在预定地点的广濑武夫，联合舰队上下对都这一次作战都充满了信心。
东乡平八郎于3月23日下达了进行第二次闭塞作战的命令，联合舰队于3月26日凌晨2点30分从仁川港出发，再次向旅顺港驶去，于下午6点到达円岛东南25海里处，闭塞船队于27日凌晨1点到达老铁山南方。
不过这一次闭塞作战从一开始就遭遇不利，船队还没接近旅顺外港，就被俄军海岸探照灯发现，岸上炮台开始猛烈炮击。
原来新任的太平洋舰队司令官马卡洛夫己在3月8日到达旅顺上任，虽然马卡洛夫接手的是一个烂摊子，但上任了不到20天，马卡诺夫却展现出了名将的素质，首先迅速罢免了一批无能的军官，将一批年轻有为的军官迅速提拔到关键岗位。又提高了普通士兵和岸上码头工人的待遇，因此伤损军舰的修复速度也明显加快；而在战术上，马卡诺夫加强了太平洋舰队的行动，改变原来的拖船使用办法，使得舰队出港时间从12个小时缩短到3个小时，并且在辽东半岛沿海地区布雷，干涉日本舰队的行动，又经常派遣舰队出海活动，一面侦察敌情，一面也是以攻代守；同时又电令海参崴分舰队出击，袭扰日军海上交通线。